Como mencionado em uma postagem recente do Blog, a metagenômica consiste em (tentar) identificar todos os micro-organismos de um ambiente. Justamente por querermos identificar os representantes dessa comunidade, à partir de dados de sequenciamento NGS, podemos também obter os genes de cada espécie presente no ambiente de interesse. Essa estratégia para obter o sequenciamento total dos micro-organismos de um determinado ambiente é chamado de Whole Genome Shotgun (WGS).